药王山庙会历史悠久，始于唐，盛于宋。有关孙思邈的传奇故事最早见于唐·段成式《酉阳杂俎》一书。宋人《太平广纪》中也有记载。宋元丰四年（1081年）刻立的《耀州华原五台山孙真人祠记》云：“此皆自古及今乡里耆众所共传也”，“故世以为神仙”，“莫不为其风而爱戴之”，“所以争相绘塑，以钦事之，而尚未息也。”可见唐时孙思邈在民间已有广泛影响，宋时纪念孙思邈已经形成习俗，并引起皇室的高度重视，宋徽宗尤为尊崇孙思邈，予以加封。刻立于宋崇宁三年（公元1104年）的《感德军五台山静应庙并加号妙应真人告词》碑云：“孙真人，其盛德茂功，显闻于世者，朕必秩而祀之。”年年祭祀孙思邈由此形成制度。

　　金元时，庙会时间基本确立并初具规模。“兴定二年仲春，适值中和之节，是日，郡人多会于静明观，熙熙然如登春台。”（金兴定二年《何仲均题字》）。元承前朝制度，由皇太子祝文，皇后御香致祭，时间均在农历正月、二月。

　　明清时，庙会起始时间完全确定下来，更加隆重热烈，并且时间很长，信众更加广泛，据碑石记载，“每岁二月二，适逢孙真人寿期，四方男妇，争相谒献。”（明正德八年《重修殿宇记》）。 “于是四方辐辏，不远千里，每岁二月二悉集焉，”“乃作祀神曲五阙（迎神、初献、亚献、终献、送神），使道士歌以祀之”（明嘉靖三十七年《孙真人祀殿记》）。“二月二日，香火期也，明时，秦人男女，无远近少长，人马丁穰之声昼夜，经月余不绝，即秦晋藩王，闲士大夫，靡不登临而拜”（清顺治十一年《施饭碑记》）。这些碑刻史料是以庙会形式祭祀孙思邈的真实写照。

　　随着时间的推移，庙会会期也完全确定下来，清末至民国期间，会期定为十天，即由二月初二起会，初六开始演戏，十一日结束。同时办会形式和祭祀典礼仪程也趋于规范化。一般按照旧例是耀州城内四街轮流办会，二月初一开洞门，初二为正会。庙会期间，四面八方商贾云集，善男信女络绎不绝。山上香火缭绕，钟磬喧天，人声鼎沸，万头攒动。最后一天为庙会高潮，往往是万人空巷，倾城而出。黄昏时分，花火、“路畔灯”、狮子、龙灯交相辉映，又有多处铁渣花火，倾天而泻，慰为奇观。晚上唱天明戏，午后开锣，黎明收场，好事者竟彻夜不眠。药王大殿又有自乐班献艺助兴，管弦悠扬，别有情趣。

　　解放后，随着政府对文物保护工作的重视和药王山的全面修复建设，药王山庙会更加盛况空前。近年同时举办药王养生文化节。并举行声势浩大的公祭药王活动。“千金方使万人活，箫鼓年年拜药王”。如今的药王山庙会已成为集信仰、商贸、旅游于一身的民间传统盛会。

　　为了使药王山庙会得到传承与发展，近年来药王山的基础设施建设不断加强，实施了亮化工程，维修了景区道路，添置了景区观光车。药王孙思邈的高尚医德和养生思想更加发扬光大，在景区建成了孙思邈国医馆、孙思邈药膳坊、药王养生酒坊。去年与今年举办的两届孙思邈中医药文化节举行的公祭药王仪式，更是庙会祭拜药王活动的延展。药王大殿内举办的国家级非物质文化遗产药王山庙会展示中心，以图片和音像的形式向人们展示药王山庙会的盛况与文化内涵。